Di regola, per quello che è la mia esperienza, l’acidità necessaria per l’acetificazione di una botte deve essere alquanto elevata (almeno 7/7,5) ed il riempimento deve essere totale, raso alla bocca della botte, rabboccando settimanalmente, o frequentemente il livello per qualche mese.
Nel suo caso, se il prodotto è acido e la madre è sottile non dovrebbero esserci problemi. Nel caso la madre fosse spessa (Xylinum) ricomincerei daccapo, senza troppi pensieri, disinfettando bene la botte con acqua bollente e sale.
In alternativa può eliminare quelle madri spesse e aumentare drasticamente l’acidità. Il batterio, però, rimane presente sempre all’interno, e potrebbe ripresentarsi in futuro se di dovesse abbassare il ° di acidità.